退休后的考古队长郑文初被绑架至东南亚某第三国家进行黑市古董交易的真伪鉴定。郑文初出逃后联合武装警卫公司追缴了流失的国宝金印，并且阻止了黑势力盗掘皇陵的计划。剧情承接《铁甲狂猴之亡命雷霆》，雷霆击败力霸与铁刹之后，苍穹又派出了更为致命的博士与银狐来追杀雷霆，雷霆逐个击破。最终雷霆重新拾起铁甲狂猴的正义使命，与苍穹展开了最终大战。。
